故事发生在前作《伊丽莎白》的十五年后，此时的英国女王伊丽莎白一世(凯特·布兰切特饰)已经被政敌的无数次阴谋暗算历练得更加强大，她已经不再把国内的阴谋家们放在眼里，因为在她身边依然有那个忠诚无二的皇家重臣弗朗西斯·沃辛汉爵士(杰弗瑞·拉什饰)守护者。而女王则开始为壮大大不列颠的实力而伤神。摆在她面前的难题主要有两个：一是对内，如何降服处处与她作对的苏格兰女王玛丽·斯图尔特(萨曼莎·莫顿饰)；第二是对外，怎样将英国海军训练装备的更加强大，从而击败来自大洋彼岸的不可一世的西班牙王国的“无敌舰队”，并最终能英国登上海上霸主的地位。然而，伊丽莎白一世虽为至高无上的女王，但作为一个同样有血有肉、有七情六欲...